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远慕生物:组蛋白抗体数据库助你选购抗体
阅读次数:35 发布时间:2019/8/9 9:50:36
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选购抗体一直是件劳心劳力的事情。搜索比较,查找文献,还不一定可靠。如今,一个新的数据库也许能消除你的烦恼。这个名为Histone Antibody Specificity Database的网站提供了经过验证的检测结果,让研究人员能够获得和比较真实世界的数据,并挑选*可靠的抗体。近日,一篇发表在《Molecular Cell》上的文章介绍了这个数据库。

“我无法想象有任何生物医学研究不依赖抗体;它们通常是许多研究中的关键,”北卡罗莱纳大学医学院的Brian D. Strahl教授谈道,他也是这篇文章的通讯作者之一。“但是,这些工具有多可靠?生物界逐渐认识到,我们需要更好的方式来了解抗体。这也是我们建立这个网站的目的。”

这个网站主要关注组蛋白的抗体,这属于新兴的表观遗传学研究领域的一部分。表观遗传学研究人员研究基因组外的信息如何控制基因的“开”和“关”,就像电灯开关一样,这反过来又影响人类健康的方方面面。研究人员利用组蛋白抗体来追踪各种蛋白在基因调控中的作用。

每个组蛋白抗体被认为与特定的蛋白目标结合,让科学家能够追踪健康和患病细胞中的蛋白如何被调节。然而,人们也发现,一些抗体与主要目标之外的其他蛋白结合,而一些抗体虽只与一个蛋白结合,但并非理想中的目标。在某些情况下,抗体的准确性和特异性随批次而变化,表明质量控制存在问题。

新的数据库提供了100多种常用的组蛋白抗体的准确性和特异性的信息。它所使用的检测方法是基于Strahl及其同事开发的肽段芯片。此芯片呈现了组蛋白上已知的所有化学修饰或“标签”。通过分析,他们能迅速弄清每个抗体能与哪种类型的标签结合。这相当重要。每个标签被认为具有不同的功能。

肽段芯片平台的消息传出去之后,Strahl及其同事就经常接到其他科学家的电话,咨询如何选择抗体。这激起了研究小组的想法:何不购买所有常用的组蛋白抗体,在芯片上检验它们,并在一个网站上公布结果?

这个网站允许用户利用多个参数搜索抗体。Strahl表示,他希望此数据库能够带来更准确、更具重复性的表观遗传学成果。“你不要指望每个抗体都是完美的,但我们希望研究人员能知道它的缺陷是什么,”Strahl说。“这样,至少人们能够谨慎地解释他们的结果。
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