凝胶色谱法又叫凝胶色谱技术，又称分子排阻色谱法，其分离物质的原理为分子筛原理,且多用于分离有机大分子化合物,如蛋白质、多肽、多糖等。

　　根据分离的对象是水溶性的化合物还是有机溶剂可溶物，又可分为凝胶过滤色谱（GFC）和凝胶渗透色谱（GPC）。凝胶过滤色谱一般用于分离水溶性的大分子，如多糖类化合物。凝胶的代表是葡萄糖系列，洗脱溶剂主要是水。凝胶渗透色谱法主要用于有机溶剂中可溶的高聚物 (聚苯乙烯、聚氯已烯、聚乙烯、聚甲基丙烯酸甲酯等) 相对分子质量分布分析及分离，常用的凝胶为交联聚苯乙烯凝胶，洗脱溶剂为四氢呋喃等有机溶剂。

　　凝胶色谱与凝胶层析基本上是一致的只是固定相存在差异。凝胶层析又称分子筛过滤、排阻层析，操作条件比较温和，可在相当广的温度范围下进行，并且对分离成分理化性质的保持有独到之处。两者的共同点是都不需要有机溶剂。凝胶色谱色谱一般用在HPLC等分析场合。而凝胶层析一般用在制备的时候。

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